Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Soga3Q6NZL0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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