Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf9bQ6NZA9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf9bQ6NZA9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf9bQ6NZA9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms