Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad17Q6NXW6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad17Q6NXW6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms