Protein–RNA interactions for Protein: Q6J1H4

Utf1, Undifferentiated embryonic cell transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utf1Q6J1H4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utf1Q6J1H4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms