Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms