Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Krt40Q6IFX3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Krt40Q6IFX3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Krt40Q6IFX3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Krt40Q6IFX3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt40Q6IFX3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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