Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms