Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap5lQ6GQX2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms