Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf8Q6DID3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms