Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop58Q6DFW4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms