Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn4Q69Z26 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms