Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp4Q68FH0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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