Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms