Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4eQ66X19 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms