Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms