Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
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Ccdc18Q640L5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
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Ccdc18Q640L5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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Ccdc18Q640L5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
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Ccdc18Q640L5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc18Q640L5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.9 ms