Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ift52Q62559 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ift52Q62559 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ift52Q62559 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ift52Q62559 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ift52Q62559 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ift52Q62559 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ift52Q62559 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift52Q62559 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift52Q62559 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift52Q62559 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift52Q62559 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ift52Q62559 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift52Q62559 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift52Q62559 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift52Q62559 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ift52Q62559 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms