Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms