Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn3Q62471 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn3Q62471 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn3Q62471 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn3Q62471 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn3Q62471 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms