Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga3Q62470 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms