Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema3cQ62181 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Sema3cQ62181 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Sema3cQ62181 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Sema3cQ62181 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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