Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3bQ62177 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms