Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms