Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms