Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga7Q61738 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms