Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd47Q61735 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd47Q61735 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms