Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1aQ61495 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1aQ61495 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms