Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne1Q61457 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms