Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BcanQ61361 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcanQ61361 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BcanQ61361 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BcanQ61361 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcanQ61361 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcanQ61361 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcanQ61361 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcanQ61361 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BcanQ61361 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcanQ61361 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcanQ61361 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BcanQ61361 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BcanQ61361 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcanQ61361 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcanQ61361 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcanQ61361 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BcanQ61361 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BcanQ61361 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcanQ61361 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcanQ61361 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BcanQ61361 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcanQ61361 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BcanQ61361 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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