Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acvr1bQ61271 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acvr1bQ61271 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms