Protein–RNA interactions for Protein: Q61001

Lama5, Laminin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 3,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama5Q61001 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lama5Q61001 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lama5Q61001 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lama5Q61001 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lama5Q61001 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms