Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms