Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp4Q60972 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms