Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HellsQ60848 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HellsQ60848 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HellsQ60848 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
HellsQ60848 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HellsQ60848 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HellsQ60848 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HellsQ60848 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HellsQ60848 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HellsQ60848 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HellsQ60848 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HellsQ60848 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HellsQ60848 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HellsQ60848 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HellsQ60848 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HellsQ60848 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HellsQ60848 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HellsQ60848 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HellsQ60848 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HellsQ60848 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.3■■□□□ 1
HellsQ60848 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HellsQ60848 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HellsQ60848 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HellsQ60848 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms