Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp1r1bQ60829 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp1r1bQ60829 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp1r1bQ60829 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp1r1bQ60829 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp1r1bQ60829 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp1r1bQ60829 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp1r1bQ60829 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp1r1bQ60829 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp1r1bQ60829 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp1r1bQ60829 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms