Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ItgaeQ60677 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms