Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms