Protein–RNA interactions for Protein: Q60604

Scin, Adseverin, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScinQ60604 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ScinQ60604 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ScinQ60604 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ScinQ60604 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ScinQ60604 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ScinQ60604 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms