Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sin3aQ60520 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms