Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E2

Repin1, Replication initiator 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Repin1Q5U4E2 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Repin1Q5U4E2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms