Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thoc6Q5U4D9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thoc6Q5U4D9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms