Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rabl6Q5U3K5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms