Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsr1Q5SWD9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms