Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms