Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Sco1Q5SUC9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Sco1Q5SUC9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sco1Q5SUC9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Sco1Q5SUC9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Sco1Q5SUC9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Sco1Q5SUC9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Sco1Q5SUC9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Sco1Q5SUC9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Sco1Q5SUC9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms