Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap44Q5SSM3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap44Q5SSM3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms