Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms