Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Gm11487Q5RIS0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm11487Q5RIS0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Gm11487Q5RIS0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Gm11487Q5RIS0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm11487Q5RIS0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms