Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms