Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG9

Znf488, Zinc finger protein 488, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf488Q5HZG9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf488Q5HZG9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf488Q5HZG9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf488Q5HZG9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Znf488Q5HZG9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Znf488Q5HZG9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Znf488Q5HZG9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Znf488Q5HZG9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Znf488Q5HZG9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Znf488Q5HZG9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Znf488Q5HZG9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Znf488Q5HZG9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Znf488Q5HZG9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Znf488Q5HZG9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf488Q5HZG9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Znf488Q5HZG9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms